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双脱氧末端终止法测序中为什么能转录出一系列长度仅相差一个碱基的DNA?

双脱氧末端终止法测序中为什么能转录出一系列长度仅相差一个碱基的DNA?

凌成献3190033005 -
回帖数:1

与单链模板(如以双链作模板,要作变性处理)结合的引物,在DNA聚合酶作用下从5’端向3’端进行延伸反应,32P随着引物延长掺入到新合成链中。当ddNTP掺入时,由于它在3’位置没有羟基,故不与下一个dNTP结合,从而使链延伸终止。ddNTP在不同位置掺入,因而产生一系列不同长度的新的DNA链。

如果第一个插入的刚好是ddNTP,那么链延伸立即终止,前面的已经终止了,后面的也转录不了了。我可以这么理解:因为在延伸过程中,有dNTP,也有ddNTP,它们是随机结合到模板上的,如果结合的是dNTP,那么可以继续延伸,如果是ddNTP,停止延伸,这样就可以得到一系列不同长度的DNA。可这堆不同长度的DNA中,一定会有一系列仅仅相差一个碱基长度的DNA片段么?这概率会不会有点小哈?

回复凌成献3190033005

回复: 双脱氧末端终止法测序中为什么能转录出一系列长度仅相差一个碱基的DNA?

欧春宝3190110006 -
个人观点:要得到仅相差一个碱基长度的DNA片段是没问题的,而且要进行检测,那么在每一个相应位点终止的DNA片段的数量都是足够庞大的。
佐证:基因结构与表达分析的基本方法 课件 第26、36页。26页是电泳显示图,36页说明终止法一般不用于较长的序列,那么做实验时底物的量比较容易满足消耗。