用诱导性多能干细胞治疗人类疾病仍然需要克服许多关键障碍。比如，添加4个“重新编程”基因或取代疾病细胞中有缺陷基因的方法都可能有导致癌症的副作用。在诱导性多能干细胞能被考虑用于人类疗法之前，研究人员需要发展出安全的方法来解决这些以及其他可能的问题。

     早在将iPSCs移植到其他小鼠体内之前，嵌合子小鼠的免疫系统就已经对来源于iPSCs的问题细胞产生了排斥或耐受。