诱导性多能干细胞还面临许多急待突破瓶颈和需要深入研究的领域： （1）研究诱导性多能干细胞自我复制、增殖和分化等的调控机制及iPS细胞体外定向诱导分化机制； （2）充分评价诱导性多能干细胞临床应用的安全性； （3）建立无遗传修饰的iPS细胞制备方法（ 如仅利用蛋白或小分子化合物即将人的细胞重编程为诱导性多能干细胞）。