1.细菌性痢疾潜伏期短，阿米巴痢疾潜伏期长

2.细菌性痢疾全身症状重，后者少见

3.前者腹痛更重，位于左下腹，后者腹痛较轻，位于右下腹

4.前者粪便量少，为粘液脓血便，涂片可见大量脓细胞、少量红细胞，培养可见志贺杆菌，后者粪便量多，为果酱样大便，涂片可见大量红细胞、少量白细胞，夏科-雷登结晶，培养可见阿米巴滋养体或包囊

5.前者血清学有抗志贺杆菌抗体，后者有抗阿米巴抗体

6.结肠镜检查可见前者病变位于乙状结肠和直肠，后者位于升结肠和回盲肠