根据病史和检查结果，该病人最可能的诊断为血吸虫病。

血吸虫病是由血吸虫寄生在人体内引起的寄生虫病，其主要症状包括腹痛、腹胀、发热等，同时伴随着肝脾肿大。血吸虫病的诊断可以通过血吸虫ELISA阳性、肝脏B超示肝可见网络样改变等检查结果来确认。

至于病程中出现的头痛、癫痫发作和一过性意识障碍，可能是由于血吸虫病引起的并发症，特别是神经系统并发症，如血吸虫性脑膜炎或血吸虫性脑病。这些并发症的发生可能与寄生虫侵袭神经系统、免疫反应等因素有关。因此，在考虑病因时，应考虑到血吸虫病可能引起的神经系统并发症。