1）根据患者的临床表现和实验室检查结果，考虑流行性乙型脑炎的诊断可能性大。患者为5岁男童，夏季发病，有急起持续性高热、意识障碍昏迷抽搐等典型症状，且体查发现颈强直。脑脊液检查结果显示白细胞数量正常，蛋白含量正常，但糖含量降低，氯化物含量正常，这符合流行性乙型脑炎的脑脊液改变特点。

2）为明确诊断，还应进行以下检查项目：

血清学检查：检测流行性乙型脑炎病毒特异性抗体，如IgM抗体，有助于早期诊断。

脑电图检查：可显示弥漫性慢波，有助于评估脑功能状态。

头颅CT或MRI检查：有助于发现脑部病变，排除其他颅内疾病。

病原学检查：如病毒分离、核酸检测等，可直接证实病原体感染。

3）针对该患者的治疗措施包括：

抗病毒治疗：早期使用抗病毒药物，如利巴韦林，以抑制病毒复制。

对症治疗：根据症状给予相应的治疗，如降温、镇静、止惊等。

防治并发症：积极预防和治疗可能出现的并发症，如肺部感染、脑水肿等。

营养支持：保证患者充足的营养摄入，维持水电解质平衡。

康复治疗：在病情稳定后，进行康复训练，促进患者功能恢复。

综上所述，针对该患者应综合考虑临床表现、实验室检查和病原学检查等多方面信息，以明确诊断并制定合理的治疗方案。同时，在治疗过程中应密切关注病情变化，及时调整治疗方案。