干细胞研究受到科学家和世人的广泛关注有其必然性，干细胞在生命科学的修复、发育生物学、药物学等领域有着极为广阔的应用前景。干细胞的主要应用包括：

（1）作为细胞治疗与组织器官替代治疗的种子细胞。

（2）在对胚胎发育过程中关键性调控机制的研究中，胚胎干细胞无疑已成为一个重要的工具。

（3）干细胞是对疾病进行基因治疗时理想载体。造血干细胞具有自我更新、多向分化 重建长期造血、采集和体外处理容易等特点。因此是基因治疗最理想的载体细胞之一，以此为基础的基因治疗，在重症免疫缺陷、遗传性疾病、恶性肿瘤、造血干细胞保护、AIDS等领域具有广阔的应用前景。

（4）胚胎干细胞与基因定位整合技术相结合，对于研究基因在胚胎发有中的表达与功能具有十分重要的意义。

（5）胚胎干细胞可以分化为多种细胞类型又能不断自我更新，这在药物研究领域具有广泛的用途。目前用于药物筛选的细胞都来源于动物或癌细胞这样非正常的人体细胞，而胚胎干细胞可以经过体外诱导，为人类提供各种组织类型的细胞，这为药物筛选、鉴定及其毒理的研究提供坚实的基础，并有助于人类疾病细胞模型的建立及新药开发。