先形成原始消化管，食管分支再形成呼吸系统。

原始咽的尾端底壁正中出现一纵行浅沟，称喉气管沟（laryngotracheal groove）。此沟逐渐加深，并从其尾端开始愈合，愈合过程向头端推移，最后形成一个长形盲囊，称气管憩室，是喉、气管、支气管和肺的原基。喉气管憩室位于食管的腹侧，两者之间的间充质隔称气管食管隔。

食管由原始咽尾侧的一段原始消化管分化而来。