五官科系统模块是南方医科大学临床医学八年制和临床医学五年制卓越创新班课程整合改革的最后一个模块，服务于两个专业课程体系改革的整体目标和专业教学方案。在前期完成人体主要系统模块的学习后，本模块汇集了与人体结构和功能有关的组织学与胚胎学、生理学以及耳鼻咽喉科、眼科、口腔科三个临床专业的内容。本模块主要临床学科具有相对的独立性，但相互间解剖部位密切相连，功能相辅相成，在疾病及创伤发生时相互影响，因此，本模块各亚模块即相互独立，又紧密相连。作为课程整合的最后一个模块内容，本模块内容与全身其他系统存在一定相关性，需在完成其他系统模块的学习后方可进行本模块的学习。

本模块总学时106学时，教学方式是理论授课与实验操作和观察相结合，理论与实践的学时比例接近3:1。在八年制五年级第二学期讲授，五年制卓越创新班在四年级第二学期讲授。