很好的问题。
事实上，对应于２０种氨基酸正好有２０种连接氨基酸与 相应tRNA的合成酶，即氨基酰tRNA合成酶，这些酶有绝对专一性。 
去除三个终止密码，编码氨基酸的密码子是６１个，tRNA并没有６１种，不同生物里的数量略有别，一般是４０种左右。 能结合同一种氨基酸的不同tRNA互为同功tRNA。
40种左右的tRNA如何识别61种密码子，这涉及到密码子的所谓“摆动性”，即密码子的第三位碱基与反密码子的第一位碱基常有不严格的互补配对，即摆动配对。
氨基酸并不能直接识别密码子，实验中如果将已结合到某个tRNA上的氨基酸改变为别的氨基酸，tRNA照样只根据自身的反密码子识别相应密码子，不管携带的氨基酸是否变化了。
相关细节可参考 蛋白质的生物合成 这一章。