恙虫病的首选药物是大环内脂类的药物，比阿奇霉素，罗红霉素等。另外，四环素类药物治疗效果也比较好。妊娠期可以应用青霉素、头孢菌素、大环内酯类、克林霉素、磷霉素，避免应用四环素、氯霉素、磺胺药、氨基糖甙类和喹诺酮类。四环素类药物是典型的致胎儿畸形的药物, 所以妊娠期妇女合并恙虫病推荐使用大环内酯类药物。