月经周期受到下丘脑-垂体-卵巢轴的调控。

下丘脑脉冲式分泌GnRH并作用于腺垂体，腺垂体受到刺激释放FSH和LH。FSH可以促进卵巢的卵泡生长、成熟并释放大量雌激素，子宫内膜从月经期转入增生期。

FSH达到一定水平时负反馈作用于下丘脑和垂体，FSH分泌减少，LH分泌增多。在FSH和LH的共同作用下促进排卵和黄体生成。黄体生成后分泌雌激素和孕激素，此时子宫内膜进入分泌期。

大量孕激素可以负反馈作用于下丘脑和垂体，抑制LH的分泌。此时黄体退化，血中雌激素和孕激素减少，子宫内膜进入月经期。 

月经期血液中雌激素和孕激素不足，负反馈作用于下丘脑和垂体，使GnRH和FSH分泌增多，卵泡发育，子宫内膜再次进入增生期。如此循环往复。