（1）睾丸前：性腺外内分泌紊乱，常源于垂体或肾上腺，精子结构异常和精浆异常：影响精子的运动获能和顶体反应等；促性腺激素缺乏如选择性促性腺功能低下型性机能减退、选择性LH缺陷症和FSH缺陷症、肾上腺皮质增生症、高泌乳素血症。

（2）睾丸

睾丸功能异常：隐睾症、精索静脉曲张、毒素、磁场、高热和外伤等理化因素皆可引起睾丸的生精障碍

（3）睾丸后：主要是由于睾丸输出导管梗阻所致

附睾功能异常：如附睾炎。

输精管功能异常：输精管肌层收缩力度不够，无法在射精时将精子快速排出；或者输精管梗阻，影响精子排出。

前列腺结构或和功能异常：慢性前列腺患者易出现纤维蛋白溶酶异常，继而引起精液不液化，影响精子的运动及受精能力。前列腺分泌物过少也可导致精子活性降低。

精囊功能异常：精囊的分泌物可为精子的运动提供能量，因此精囊功能异常可导致精子的运动能力减退。

尿道球部功能异常：尿道球部不能正常在射精前分泌粘液润滑尿道，导致射精障碍。

阴茎：如精索静脉曲张等都可能使精子不能正常射出。

环境问题、遗传问题如（XYY综合征、男性假两性畸形）等