1.病原及流行病学：细菌性痢疾致病菌为志贺菌，散发，可引起流行；阿米巴痢疾病原体为阿米巴原虫，散发。

2.全身症状：细菌性痢疾全身症状较重，多有发热，毒血症明显；阿米巴痢疾症状轻微，多不发热，毒血症少见。

3.胃肠道症状：菌痢腹痛重、里急后重、便次数大于10次/天；阿米巴痢疾腹痛轻，无里急后重，腹泻数次/天。

4.腹部压痛：菌痢多见于左下腹；阿米巴痢疾多见于右下腹。

5.粪便检查：菌痢量少，黏液脓血便，鲜红或红色胶冻状满视野大量成堆白细胞，散在红细胞；阿米巴痢疾量多，暗红色果酱样便，腥臭，镜检成串的陈旧红细胞，少量白细胞，常有夏科一雷登结晶，有阿米巴滋养体

6.便细菌培养：菌痢培养志贺菌阳性；阿米巴痢疾志贺菌培养阴性

7.结肠镜：菌痢镜检可见肠粘膜弥漫性充血，水肿，浅表溃疡；阿米巴痢疾见散在溃疡，烧瓶样，溃疡间粘膜正常。