急性细菌性痢疾：病原体是志贺菌，流行病学是散发性，潜伏期通常是数小时至7天，临床表现为多有发热及毒血症状，腹痛重，有里急后重感，腹泻每天十余次或数次多为左下腹压痛；粪便检查为便量少，黏液脓血便，镜检有大量白细胞及红细胞，可见吞噬细胞。粪便培养有志贺菌生长。结肠镜检查为肠粘膜弥漫性充血、水肿及浅表溃疡，病变以直肠、乙状结肠为主。

急性阿米巴痢疾：病原体是溶组织内阿米巴，流行病学是散发性，潜伏期通常是数周至数月，临床表现为多不发热少有毒血症状，腹痛轻，无里急后重，腹泻每天数次，多为右下腹压痛。粪便检查：便量多，暗红色果酱样便，腥臭味浓，镜检白细胞少，红细胞多，有夏科莱登晶体。可找到溶组织内阿米巴滋养体。结肠镜检查：有散发溃疡，边缘深切，周围有红晕，溃疡间粘膜充血较轻，病变主要在盲肠、升结肠，其次为乙状结肠和直肠。