女性生殖系统的自然防御机制有：

1、 女性外阴的大、小阴唇两侧相合，像两道门一样将阴道口、尿道口遮掩起来。

2、 女性骨盆底有许多肌肉组织。在这些盆底肌肉的作用下，使阴道口平时处于闭合状态，阴道前、后壁紧贴，从而抵御外界致病因素的侵入。

3、 妇女卵巢分泌的雌激素能促使阴道上皮细胞增生变厚，对病原体的抵抗力增强。

4、 阴道上皮细胞内含有丰富的糖原，而正常妇女的阴道中寄生着一种叫阴道乳酸杆菌的细菌，它能使这些糖原分解为单糖，再分解成乳酸，使阴道内环境呈酸性，pH值保持在4.2-5。宜于在碱性环境中生长的病原体因此会受到抑制，即阴道的自净作用。

5、 在卵巢分泌的性激素的作用下，子宫颈粘膜的腺体能分泌出碱性粘液，形成粘液栓，堵塞宫颈管，将子宫颈管与外界环境隔离开，减少了细菌侵入的可能。

6、 宫颈内口处于闭合状态，可以阻止病原体的入侵。

7、 随着卵巢分泌的性激素的周期性变化，育龄期妇女的子宫内膜也发生周期性的剥脱，产生月经。随着子宫内膜的剥脱和经血的排出，侵入宫腔的病原体也得到清除的机会。

8、 输卵管粘膜的上皮细胞分化成纤毛细胞，这些纤毛能够向子宫方向摆动，加之输卵管的蠕动作用，都会对侵入输卵管的致病菌起到清除作用。

9、 生殖道的免疫系统，识别和清除侵入生殖系统的病原体。