细菌性痢疾和阿米巴痢疾的鉴别可以从以下三个方面进行：

1. 病因：细菌性痢疾是由痢疾杆菌引起的，而阿米巴痢疾是由阿米巴原虫引起的。
2. 症状：细菌性痢疾的症状通常包括发热、腹痛、腹泻、里急后重和黏液脓血便等。而阿米巴痢疾的症状通常较为缓慢，可能会出现腹泻、腹痛、体重下降、贫血等，但其典型的症状是出现果酱样大便，伴有腥臭味。
3. 检查结果：在检查方面，通过大便的细菌培养，可以找到痢疾杆菌，从而确认是细菌性痢疾。阿米巴痢疾则可以通过检查大便中的阿米巴原虫来确认。