临床表现：①菌痢有畏寒发热，腹泻次数多（＞10次/d）但量少，为黏液脓血便，里急后重感明显，左下腹压痛。②阿米巴痢疾少发热，腹泻＜10次/d但粪质多，有腥臭味，为暗红色果酱样便，一般无里急后重感，腹部压痛以右侧为主。

粪便常规：粪便镜检可见满视野散在红细胞和成堆白细胞（≥15/高倍视野）提示菌痢。

病原体培养：粪便培养出痢疾杆菌/粪便直接镜检发现溶组织内阿米巴滋养体或包囊。

血清学检查：检测痢疾杆菌的抗原/检测出溶组织内阿米巴滋养体的抗原、ELISA检出特异性抗体。

核酸检测：PCR检测出粪便、脓液中痢疾杆菌/溶组织内阿米巴滋养体的DNA。