1、病原及流行病学：细菌性菌痢为志贺菌，散发，可引起流行；阿米巴痢疾为阿米巴原虫，散发。

2、全身症状：细菌性痢疾较重，多有发热，毒血症明显；阿米巴痢疾轻微，多不发热，毒血症少见。

3、胃肠道症状：细菌性菌痢腹痛重，里急后重，便次数＞10次/天；阿米巴痢疾腹痛轻，无里急后重。

4、腹部压痛：细菌性痢疾左下腹多见；阿米巴痢疾右下腹多见。

5、粪便检查：细菌性菌痢量少，粘液脓血便，鲜红或红色胶冻状满视野大量成堆白细胞，散在红细胞；阿米巴痢疾量多，暗红色果酱样便，腥臭，镜检成串的陈旧红细胞，少量白细胞，常有夏科-雷登结晶，有阿米巴滋养体。

6、便细菌培养：细菌性菌痢志贺菌培养阳性，阿米巴痢疾培养阴性。

7、结肠镜：细菌性痢疾肠粘膜弥漫性充血，水肿，浅表溃疡；阿米巴痢疾散在溃疡，烧瓶样，溃疡间粘膜正常