细菌性痢疾的特征在于其病原体为志贺菌，患者通常会出现较重的全身症状，包括发热和毒血症。腹痛较为剧烈，且常伴有里急后重感，尤其是左下腹部有压痛。粪便表现为黏液脓血，其中含有大量的白细胞和脓细胞。粪便培养可发现志贺菌，通常结果为阳性。

阿米巴痢疾则由溶组织内阿米巴引起，其全身症状相对较轻，很少出现发热和毒血症。腹痛较轻，通常没有里急后重感，且右下腹部有压痛的情况较为常见。粪便外观呈暗红色果酱状，有腥臭味，含有少量白细胞，可能会出现夏科-莱登结晶和阿米巴滋养体。粪便培养志贺菌通常为阴性。