1.病原及流行病学：细菌性痢疾病原体为志贺菌，科散发也可流行。阿米巴痢疾为阿米巴原虫，多为散发。

2.全身症状：前者较重，多有发热，毒血症明显。后者轻微，多无发热，毒血症少见。

3.胃肠道症状：前者腹痛重，多见左下腹痛，有里急后重，便次频繁，＞10次/天。后者腹痛轻，多见左下腹痛，无里急后重，腹泻数次/天。

4.粪便检查：前者量少，粘液脓血便，鲜红或红色胶冻状满视野大量成堆红细胞，散在白细胞。后者量多，暗红色果酱样便，腥臭，镜检成串的陈旧红细胞，少量白细胞，常有夏科雷登结晶，有阿米巴滋养体。

5.细菌培养：前者志贺菌培养阳性。后者培养志贺菌阴性。

6.结肠镜：前者肠粘膜弥漫性充血水肿，浅表溃疡。后者散在溃疡，烧瓶样，溃疡间粘膜正常。