1.少量志贺菌没有被胃酸杀死，进入下消化道，由于正常菌群的拮抗挥着肠道分泌型免疫球蛋白阻断其对肠粘膜的吸附而无法致病。当人体免疫低下时，细菌可以侵入结肠，经过基底膜进入固有层进行繁殖，释放毒素，引起黏膜上皮细胞炎症、坏死、溃疡，导致腹痛、腹泻和黏液脓血便。

2.慢性菌痢要采用全身和局部的综合治疗。

一般治疗：营养丰富、容易消化的食物，忌生冷腻，治疗同时存在的慢性消化道疾病和肠道寄生虫病。

病原治疗：根据药敏试验结果选择2种不同类型有效抗菌药物联合使用，适当延长疗程。

对症治疗：肠道功能紊乱者可以用镇静或解痉药物，或者微生态制剂。